Разница в расположении объектов, смоделированных в 3ds max, в игре

[TRam_]

- линкую точку привязки к кубу

зачем? Это не нужно.

- экспортирую в другой im-файл объекты Dummy и цилиндр (уже с анимацией)

тут лучше по-другому делать.

1) у меши с анимацией должна быть хотя бы одна неподвижная деталь, которая линкуется к b.r.main, а сама b.r.main при этом неанимирована
2) для цилиндра должна быть своя анимированная дамми. Причём при линковке следует соблюдать порядок - сначала детали к своим дамми, потом дамми к дамми вниз по иерархии
3) в 0 кадре анимации все дамми должны иметь повороты 0,0,0 в глобальных координатах. Иначе анимация разваливается.

только почему расположение цилиндра отличается от указанного в процессе моделирования?

а у тебя цилиндр располагается точно в точке 0,0,0 ? Ты ж не забывай, что к точке привязки цепляется центр сцены а не центр цилиндра

Почему игра некорректно отображает цвет?

попробуй поиграться с настройками освещения - http://www.trainsim.ru/forum/showthread.php?t=7725 (в 12 трейнзе пункт edit environment в main menu)