Микроконтроллеры. Всё обо всём.

[E69]

Вот с Ардуино еще не знаком. Рановато пока туда лезть)

Наоборот, он создан для начинающих и проще, чем Атмеловские официальные продукты. Собственная плата ускоряет разработку и действительно может быть дешевле в розницу, хотя для компактных и массовых проектов её применение неудобно. И да, на низкий уровень залезть сложнее, но сейчас возможности таковы, что это оказывается действительно необходимым не так часто.
Единственное, для Ардуино нет симулятора, как у Атмел/avr, тестить программы можно только в железе.

можно ведь взять ардуино уно, менять МК (главное чтоб подходил) и прошивать как душе угодно?

В принципе это можно (обвязку, разумеется, каждый раз придется паять для новых мест установки). Более того, с уно в принципе можно программировать и некоторые другие контроллеры АВР, например, тот же про мини, не имеющий встроенного программатора (хотя удобнее купить программатор для него, чем тянуть провода).