Dmytro, проверь жесткий диск на бэды, раз у тебя файлы вдруг читаться перестают, потом безобидный бантик, выполняющий стандартное копирование вдруг виснет без объяснения причин (MSTS тут близко не лежала

в смысле её глюков, но есть проблема с её файлами).
Видимо MSTS для размещения файлов достались дорожки на пластинах HDD с возможными бэдами, вот и лагает несчастная, другие проги это может запросто пока что не затрагивать.