В итоге все равно придете к Ардуино. Ибо на сегодняшний день нет удобнее и дешевле платформы с Atmel контроллерами на борту. Мне нравится в ней наличие встроенного USB-Uart конвертера, который позволяет прошивать контроллер по USB, не прибегая к использованию ISP программаторов типа USBASP. Плюс куча различных модулей периферрии на все случаи жизни, совместимые с этой платформой. Даже если самому по раздельности покупать микроконтроллер, обвязку к нему из кварца, кондеров и резистора на Reset, сделать плату самому, то выйдет дороже, чем купить Arduino Pro Mini, к примеру.
Ну а раз Вы на Си пишите, то стандартная программная оболочка для разработки программ Ардуины (Arduino IDE) Вам придется по душе
