[E69]

При игре иногда не могу отцепится от состава.

Видимо, глюк или проблема с настройками сцепок.

Кто-то может объяснить систему работы торможения поезда? Есть 4 режима ОТПУШЕН/ХОД/ПОЛНОСТЬЮ ДЕЙСТВУТ/АВАРИЯ.

"Аварией" (экстренным тормозом то есть) вообще пользоваться не рекомендуется, ну это понятно.
Теперь смотри: нормальное положение тормоза - "ход". Затем ставишь кран машиниста в положение "полностью действует" и смотришь на манометр, показывающий давление в тормозном цилиндре - оно начинает постепенно расти от 0 вверх. Когда стрелка доходит, скажем, до 1 или 2 атм., возвращаешь кран в положение "ход". Давление должно перестать изменяться. Поезд будет постепенно тормозится.
Когда скорость приближается к желаемой, ставишь ручку в положение "отпущен", пока давление не упадёт до 0, тормоза отпущены, поезд может свободно ехать дальше. Рукоятку можно вернуть в "ход".
Если только я не перепутал названия позиций, как они переведены в МСТС (а переведены криво).

2.1 Как на пассажирском поезде так расчитать торможение чтобы остановится посередине платформы ?

Методом долгих проб и ошибок. С некоторым опытом сможешь тормозить грубо до малой скорости, затем подъезжать на ней к началу платформы и быстро останавливаться окончательно.

Когда такое происходит борюсь так. Если он не едет вперед, толкаю реверсом, потом снова вперед, и он едет . Но за это штрафуют, пишется повреждения грузов.

Если вообще не едет - иногда надо нажать Z. Но поскольку назад поезд всё же трогается, то дело здесь не в этом.
При трогании поезд не боксует? Если по F5 пишет "Wheelsleep indicator", то попробуй сыпать песок (X). Аккуратно сдать назад, чтобы сжать сцепки, и затем трогаться,- так делают и на практике.

5. Как в реальности машинист тормозит поезд. Какие из 3-х тормозов использует, насколько интенсивно?

Главный тормоз - поездной.
Хотя на высоких скоростях и вообще по мере исправности/наличия/возможности стараются прибегать к электрическому торможению, это экономит энергию (при рекуперации), сохраняет от истирания колодки.

Если я останавливаюсь на пустом локомотиве чтобы перейти на другую стрелку, и мне надо сразу назад, корректно ли этоделать при помощи реверса? Мне просто интересно . Не в игре, по-настоящему.

Переключить стрелку колёсами движущегося поезда (взрезать стрелку)? На трамвае это в норме вещей, на железной дороге - строго запрещено, поскольку обычно приводит к её поломке, не говоря уже о том, что для того чтобы это сделать, надо сначала допустить другое нарушение - проехать под запрещающий сигнал.

Тепловоз оборудован КЛУБ

КЛУБ - комплексное локомотивное устройство безопасности, "помогающая" машинисту электроника.

Главные пути на станции. Где они ?

Главные пути - являющиеся продолжением перегона. Иначе говоря, те пути, на которые можно заехать с перегона, не отклоняясь по стрелкам (и, соответственно, не снижая для этого скорости).