В ТРС12 режима совместимости нет. Старый контент там вполне уживается если нет ошибок. Что касается ремонта объектов, тут надо смотреть конкретно в каждом случае, универсального способа нет. Вот, кстати, тема по исправлению ошибок есть, почитай.
http://www.trainsim.ru/forum/showthread.php?t=9301