Отверстие - пространство между опорами моста или путепровода, в котором находится водоток или пересекаемые пути:
http://dic.academic.ru/dic.nsf/stroitel/3336
http://dic.academic.ru/dic.nsf/railway/1760
"Перекрыть отверстие" - создать препятствие водотоку или движению транспортных средств.