А если partition для установки Windows создать другой программой ещё до начала установки. Gparted или Acronis DD.
И зачем конверт если HDD форматируется как новый.
Добавлено через 21 минуту
Когда ставлю ОС на пустой диск - для его разметки обычно пользуюсь программой Gparted с этого LiveUSB:
http://www.system-rescue-cd.org/
Вот мануал:
https://gparted.org/
Создаю partitions в такой последовательности (от центра к краю):
1. Logical NTFS или FAT32 для хранения данных
2. Logical Linux Swap (резерв для виртуальной памяти около 6 GB)
3. Primary NTFS for Windows
4. Primary EXT3 for Linux
5. Primary NTFS for boot manager
И потОм уже устанавливаю Windows на partition 3, причём виртуальную память Windows распределяю на partition 5, а для Linux она распределяется на partition 2. После завершения установок операционных систем делаю страховые копии partitions 3 и 4 в файлы образа на partition 1.