Раз запускается, значит проблема не в ПС. По поводу превышения кол-ва CON-файлов ничего сказать не могу - с самого начала начал использовать
Train Store (поэтому не знаю каково критическое их кол-во). Так что если в этом проблема - то тут поможет только эта программа.