Есть такой инструмент в шопе- color sampler tool(это где пипетка). Я надеюсь слои еще не сведены в один!?
Если сведены, тогда расслаиваем темные и светлые участки, иначе пропускаем данный пункт.
Вот картинка, как я делаю.

Пояснения:
1. Ставим 2 пипетки в местах наиболее похожих местах фотки.
2. Sample Size подбирается опытным путем, в зависимости от размера похожей области.
3. Запоминаем цифры RGB с 1 пипетки и вызываем color balance. снять галку Preserve Lumenosity (Сохранять яркость). Подкручивая ползунки RGB, добиваемся совпадения цифр RGB 1 и 2 пипеток.
4. повторяем п.1-3 до достижения нужного результата.
и напоследок, мой алгоритм сбора бортов с 3-4 фоток.
1. выведение каждой фотки по геометрии (бочка, горизонт и т.д.) без цветокоррекции.
2. сбор фоток в кучу и корректировка их по месту. Т.к. фотки делаю с небольшим перехлестом, подчищаю непонравившиеся смежные куски.
3. Имея собранный борт в слоях начинаю делать цветокоррекцию каждого слоя относительно предыдущего. по окончанию работ сохраняю и в PSD, и в BMP.
ЗЫ Иногда приходится делать общую цветокоррекцию всех фоток до выведения геометрии.
ЗЗЫ Вообщем, алгоритм меняется в зависимости от фотоматериала...
Дерзайте и найдете свой рецепт. Удачи.