Конвертить с помощью PM2IM надо с осторожностью: после этого часто модели начинают блестеть. Поставь в настройках программы (Options) галочку у пункта "Zero speculars". Перед конвертом сохрани резервную копию исходного IM (если РМ, то просто не удаляй его), а после конверта проверь работу объекта в игре, покрутись вокруг него. Если не блестит, как зеркало, то оставляй. Если заблестел (а раньше этого не было), возвращай его в исходный вид. Описанную тобой ошибку, когда текстура указана дважды, надо исправлять при помощи НЕХ-редактора. Onetex - это "одна текстура", а если она в меше прописана дважды, то вторая всё равно не работает, её надо вырезать.
Здесь есть подробная инструкция (сообщение jim_spb).