Скорее всего такое явление вызвано глюками MSTS, но для верности всё таки решил проехать ещё разок и привожу скриншоты и время. Время проследования станций такое:
Вишнёвое проезд выходного не позднее 7-52 (иначе сценарий завершится неудачей)
Боярка 7-57
Васильков 8-05
По Мотовиловке распишу подробнее:
Проезд входного 8-14 (можно раньше)
Главное здесь заехать на 6 путь и не задерживать прибытие 073 (защиту от задержки прибытия 073 к сожалению пока не сделал). После заезда на 6 путь видно, что все благополучно прибыли на станцию, в том числе и поезд №078 из 5 миссии
073 начинает отправляться где-то в районе 8-21
В 8:21,30 он должен уже покинуть станцию (если присмотреться виден хвост состава)
За 073 поездом сразу должны давать отправление тебе. В 8-22 на выходном уже желтый. Но я обычно жду Ж-З сигнала.

Кстати, примерно одновременно с тобой должен отправляться и 078 поезд, что он и делает на скриншоте
Чтобы наверняка тебе дали путь рекомендую либо полностью отпустить все тормоза, либо если и это не помогает, то сделать тягу 1% и зажать тормоз локомотива. Так в реальности, по моему, не делают, но против MSTS помогает очень хорошо