Да у меня тоже была такая вещь. Но она возникла только после того как я поставил 2 патч для метро. Там добавляются обьекты и светосигналка российского метро. Просмотрев роут через AE, стало ясно, что на ВДНХ лежат секции пути не воспринимаемые файлом tsection.dat, который работает на тунели, специальных секций. Это видимо деятели трейндривера, что то там намурили. Удалить эти секции тоже не получилось, т.к. нельзя зайти в RE, со стандартным tsection.dat.

Это надо делать через, файлы роута.
Однако у меня этот патч вообще не удаётся установить, потому что после установки игру нельзя запустить, пришлось даже делать рез. копии папки Global.

Поэтому я на этот роут пока забил.