Думаю, что основная причина дымного выхлопа 2ТЭ25К это все таки высокофорсированный дизель. Посмотрите на 2ТЭ116У - они дымят не сильнее чем ТЭП70БС

Причем на 2ТЭ25К проблемы имеются не только с дымностью выхлопа, но и с приемистостью дизеля и с его экономичностью на промежуточных позициях. Собственно эти проблемы и сподвигли коломенцев установить на 2ТЭ25А турбокомпрессоры с перепуском газов от компрессора к турбине.